草本芳疗的发源是东西方传承数千年的草本疗法，在东西方的医学古籍中均有大量记述。众所周知植物靠着光合作用产生各种成分，为自己维持生命、抵御虫害和自然界侵袭，这些成分在高温和挤压下会释出。无论在西方或是东方，自古以来人们就通过燃烧、浸泡、煎煮等各种方式运用植物的这些有效成份为人体实现疗愈。从公元1011年，阿拉伯医学家阿维森纳发明了现代蒸馏技术后，精油开始在西方出现，并广为流传。直至17世纪西方试验化学的产生，人工合成药物才成为现代医学主流。

近现代医学专业人士越来越意识到西方医学和化工制药存在很多弊端，无法从根源上实现提高人体自愈能力的目标，从而再次将焦点转向草本芳疗等自然疗法。这使得以精油的运用为核心的草本芳疗再次受到广为关注和运用。